Je suis Professeur au Département d'informatique à l'Université de Sherbrooke et un membre du
GRIF - Groupe de recherche en informatique fondamentale de l'UdeS. Mon sujet de recherche principal est la bioinformatique, où je travaille sur la reconstruction d'histoires évolutives des gènes et des espèces ainsi que sur la prédiction de gènes orthologues.
Je m'intéresse particulièrement à la classification des types de duplications qui affectent les gènes pendant l'évolution, ce qui nous permettra de comprendre comment ces gènes font l'acquisition de nouvelles fonctions.
Je suis également un adepte passionné (et contributeur occasionnel) de la théorie des algorithmes, et j'aime appliquer les derniers développements en matière d'algorithmes d'approximation et de complexité paramétrée (fixed-parameter tractability, ou FPT) à des problèmes en biologie computationelle.
Avant d'occuper ce poste, j'étais stagiaire postdoctoral à l'Université d'Ottawa avec David Sankoff, et j'ai obtenu mon PhD à l'Université de Montré en 2016 avec Nadia El-Mabrouk.
Je suis également un adepte passionné (et contributeur occasionnel) de la théorie des algorithmes, et j'aime appliquer les derniers développements en matière d'algorithmes d'approximation et de complexité paramétrée (fixed-parameter tractability, ou FPT) à des problèmes en biologie computationelle.
Avant d'occuper ce poste, j'étais stagiaire postdoctoral à l'Université d'Ottawa avec David Sankoff, et j'ai obtenu mon PhD à l'Université de Montré en 2016 avec Nadia El-Mabrouk.
CV Sommaire
Dernière mise à jour : septembre 2023 (ce qui n'est pas trop loin dans le passé, j'espère)
Postes
| 2023-... | Professeur agrégé à l'Université de Sherbrooke |
| 2018-2023 | Professeur adjoint à l'Université de Sherbrooke |
| 2016-2018 | Postdoctorat à l'Université d'Ottawa (avec Dr. David Sankoff) |
Éducation
| 2012-2016 | PhD en informatique, Université de Montréal. Superviseur: Nadia El-Mabrouk Thèse jugée Exceptionnelle, sur la liste d'honneur du Doyen, 4.3/4.3 GPA |
| 2011-2012 | MSc en informatique, Université de Montréal. (passage accéléré au doctorat) |
| 2005-2010 | BSc en informatique et génie logiciel (programme avec stages Co-op), UQAM. |
Comités et évaluations
| - Comité de programme: WABI 2023, 2022, 2021, 2020, 2019 |
| - Comité de programme: ISMB 2023, 2022, 2021, 2020, 2019, 2018 |
| - Comité de programme: RECOMB-CG 2023, 2022, 2021, 2020, 2019, 2018 |
| - Comité de programme: IWOCA 2023 |
| - Comité de programme: APBC 2023, 2022, 2021, 2020, 2019 |
| - Comité de programme: ISBRA 2023, 2022 |
| - Comité de programme: SOFSEM 2020, 2019 (computational biology session, upcoming) |
| - Comité de programme: ICCABS 2021, 2020, 2019, 2018, 2017 |
| - Comité d'organisation: RECOMB-CG 2018 |
| - Comité d'organisation: RECOMB-CG 2016 |
Prix et financement
| 2022-2025 | NOVA - FRQNT-NSERC PROGRAM for junior researchers Novel Metrics for the Comparison of Phylogenetic Networks, $225K |
| 2019-2025 | NSERC - Discovery Accurate prediction and classication of orthologs, $255K |
| 2022-2023 | NSERC - Alliance Catalyst International A Bioinformatics Framework to Understand the Fate of Duplicated Genes, $25K |
| 2021-2023 | FRQS - financements de la recherche intersectorielle sur le Vieillissement Analyse de réseaux pour resserrer le filet social autour des personnes âgées, $86K |
| 2021-2022 | FRQNT - Research support for new academics Reconciliation between gene and species trees in the era of phylogenomics, $60K |
| 2016-2018 | NSERC Postdoctoral Scholarship |
| 2016 | Mitacs Globalink Campus France Award (pour une collaboration de 5 mois avec Dre. Celine Scornavacca) |
| 2015 | Hydro-Québec Excellence Award |
| 2014 | DIRO Excellence Award (University of Montreal) |
| 2014-2016 | FRQNT Doctoral Scholarship |
| 2012-2013 | FRQNT Masters Scholarship |