Manuel Lafond
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manuel.lafond at USherbrooke.ca
+1 819-821-8000 ext. 62034
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Je suis Professeur au Département d'informatique à l'Université de Sherbrooke et un membre du GRIF - Groupe de recherche en informatique fondamentale de l'UdeS. Mon sujet de recherche principal est la bioinformatique, où je travaille sur la reconstruction d'histoires évolutives des gènes et des espèces ainsi que sur la prédiction de gènes orthologues. Je m'intéresse particulièrement à la classification des types de duplications qui affectent les gènes pendant l'évolution, ce qui nous permettra de comprendre comment ces gènes font l'acquisition de nouvelles fonctions.

Je suis également un adepte passionné (et contributeur occasionnel) de la théorie des algorithmes, et j'aime appliquer les derniers développements en matière d'algorithmes d'approximation et de complexité paramétrée (fixed-parameter tractability, ou FPT) à des problèmes en biologie computationelle.

Avant d'occuper ce poste, j'étais stagiaire postdoctoral à l'Université d'Ottawa avec David Sankoff, et j'ai obtenu mon PhD à l'Université de Montré en 2016 avec Nadia El-Mabrouk.

CV Sommaire
Dernière mise à jour : septembre 2023 (ce qui n'est pas trop loin dans le passé, j'espère)
Postes
2023-... Professeur agrégé à l'Université de Sherbrooke
2018-2023 Professeur adjoint à l'Université de Sherbrooke
2016-2018 Postdoctorat à l'Université d'Ottawa (avec Dr. David Sankoff)
Éducation
2012-2016 PhD en informatique, Université de Montréal. Superviseur: Nadia El-Mabrouk
Thèse jugée Exceptionnelle, sur la liste d'honneur du Doyen, 4.3/4.3 GPA
2011-2012 MSc en informatique, Université de Montréal. (passage accéléré au doctorat)
2005-2010 BSc en informatique et génie logiciel (programme avec stages Co-op), UQAM.
Comités et évaluations
- Comité de programme: WABI 2023, 2022, 2021, 2020, 2019
- Comité de programme: ISMB 2023, 2022, 2021, 2020, 2019, 2018
- Comité de programme: RECOMB-CG 2023, 2022, 2021, 2020, 2019, 2018
- Comité de programme: IWOCA 2023
- Comité de programme: APBC 2023, 2022, 2021, 2020, 2019
- Comité de programme: ISBRA 2023, 2022
- Comité de programme: SOFSEM 2020, 2019 (computational biology session, upcoming)
- Comité de programme: ICCABS 2021, 2020, 2019, 2018, 2017
- Comité d'organisation: RECOMB-CG 2018
- Comité d'organisation: RECOMB-CG 2016
Prix et financement
2022-2025 NOVA - FRQNT-NSERC PROGRAM for junior researchers
Novel Metrics for the Comparison of Phylogenetic Networks, $225K
2019-2025 NSERC - Discovery
Accurate prediction and classication of orthologs, $255K
2022-2023 NSERC - Alliance Catalyst International
A Bioinformatics Framework to Understand the Fate of Duplicated Genes, $25K
2021-2023 FRQS - financements de la recherche intersectorielle sur le Vieillissement
Analyse de réseaux pour resserrer le filet social autour des personnes âgées, $86K
2021-2022 FRQNT - Research support for new academics
Reconciliation between gene and species trees in the era of phylogenomics, $60K
2016-2018 NSERC Postdoctoral Scholarship
2016Mitacs Globalink Campus France Award (pour une collaboration de 5 mois avec Dre. Celine Scornavacca)
2015Hydro-Québec Excellence Award
2014DIRO Excellence Award (University of Montreal)
2014-2016FRQNT Doctoral Scholarship
2012-2013FRQNT Masters Scholarship